Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm20547B8JJN0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm20547B8JJN0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm20547B8JJN0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm20547B8JJN0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm20547B8JJN0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm20547B8JJN0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm20547B8JJN0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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