Protein–RNA interactions for Protein: B8JJD6

Fance, Fanconi anemia, complementation group E, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanceB8JJD6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FanceB8JJD6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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