Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Siah3B2RWG3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms