Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5640A3KG49 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5640A3KG49 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms