Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Samt1A2BED8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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