Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Calcoco2A2A6M5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms