Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Z7

Trav5-1, T cell receptor alpha variable 5-1 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav5-1A0A075B5Z7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trav5-1A0A075B5Z7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trav5-1A0A075B5Z7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trav5-1A0A075B5Z7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trav5-1A0A075B5Z7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trav5-1A0A075B5Z7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trav5-1A0A075B5Z7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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