Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn2r25W4VSP2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms