Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Vamp5Q9Z2P8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms