Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psmb3Q9R1P1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms