Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnnt3Q9QZ47 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnnt3Q9QZ47 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms