Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Exo1Q9QZ11 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms