Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
VapbQ9QY76 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
VapbQ9QY76 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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