Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PdcQ9QW08 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PdcQ9QW08 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms