Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cabp1Q9JLK7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms