Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gde1Q9JL56 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms