Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hmgn5Q9JL35 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hmgn5Q9JL35 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms