Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tuba8Q9JJZ2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tuba8Q9JJZ2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms