Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc22Q9JIG7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc22Q9JIG7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms