Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn12Q9ET43 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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