Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms