Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SgshQ9EQ08 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms