Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnft1Q9DCN7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnft1Q9DCN7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rnft1Q9DCN7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnft1Q9DCN7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnft1Q9DCN7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnft1Q9DCN7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnft1Q9DCN7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnft1Q9DCN7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnft1Q9DCN7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rnft1Q9DCN7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnft1Q9DCN7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnft1Q9DCN7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnft1Q9DCN7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnft1Q9DCN7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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