Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms