Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fundc1Q9DB70 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fundc1Q9DB70 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms