Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn9Q9D805 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn9Q9D805 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms