Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc3Q9D6Y1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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