Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfn4Q9D6I3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pfn4Q9D6I3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms