Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ube2cQ9D1C1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms