Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx17Q9D0I4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx17Q9D0I4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms