Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nde1Q9CZA6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms