Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Nicn1Q9CQM0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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