Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
SptssbQ925E8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms