Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Odf3Q920N1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms