Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lims2Q91XD2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms