Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Snx15Q91WE1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Snx15Q91WE1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx15Q91WE1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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