Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx9Q91VH2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx9Q91VH2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms