Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf183Q8QZS5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf183Q8QZS5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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