Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc12Q8K5B8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms