Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MyripQ8K3I4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms