Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Abcf3Q8K268 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Abcf3Q8K268 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Abcf3Q8K268 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Abcf3Q8K268 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Abcf3Q8K268 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Abcf3Q8K268 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Abcf3Q8K268 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Abcf3Q8K268 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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