Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Neurl3Q8CJC5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Neurl3Q8CJC5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms