Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clip4Q8CI96 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms