Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Mterf1aQ8CHZ9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mterf1aQ8CHZ9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms