Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nhlrc3Q8CCH2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Nhlrc3Q8CCH2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nhlrc3Q8CCH2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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