Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg16l1Q8C0J2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atg16l1Q8C0J2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms