Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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