Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pja2Q80U04 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms