Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad54bQ6PFE3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms