Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg9bQ6EBV9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms